Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP25Q9UHP3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP25Q9UHP3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms