Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHORDC1Q9UHD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms