Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IFT172Q9UG01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IFT172Q9UG01 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IFT172Q9UG01 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms