Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DKK2Q9UBU2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK2Q9UBU2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms