Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HDAC6Q9UBN7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDAC6Q9UBN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms