Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPARGC1AQ9UBK2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms