Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK-18Q9QC07 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK-18Q9QC07 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms