Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms