Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RRBP1Q9P2E9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RRBP1Q9P2E9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms