Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN3Q9P232 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms