Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4Q9P0V3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP4Q9P0V3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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SH3BP4Q9P0V3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4Q9P0V3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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