Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CXXC1Q9P0U4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms