Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GGA3Q9NZ52 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GGA3Q9NZ52 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms