Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PGPEP1Q9NXJ5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PGPEP1Q9NXJ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms