Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRMT1Q9NXH9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT1Q9NXH9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms