Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX58

LYAR, Cell growth-regulating nucleolar protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYARQ9NX58 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LYARQ9NX58 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LYARQ9NX58 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms