Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM248Q9NWD8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms