Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UFSP2Q9NUQ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFSP2Q9NUQ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms