Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMBRD1Q9NUN5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms