Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC39A9Q9NUM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A9Q9NUM3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms