Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF146Q9NTX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF146Q9NTX7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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