Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECHDC1Q9NTX5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ECHDC1Q9NTX5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECHDC1Q9NTX5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms