Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCND1Q9NSA2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms