Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB6BQ9NRW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB6BQ9NRW1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms