Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SDR39U1Q9NRG7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms