Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLE3Q9NRF9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLE3Q9NRF9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms