Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPRD1BQ9NQG5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPRD1BQ9NQG5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms