Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms