Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NLRC4Q9NPP4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRC4Q9NPP4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms