Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNK9Q9NPC2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNK9Q9NPC2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms