Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6orf50Q9HD87 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf50Q9HD87 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms