Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRPM3Q9HCF6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRPM3Q9HCF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms