Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC4Q9HBW1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC4Q9HBW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms