Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C8orf33Q9H7E9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf33Q9H7E9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms