Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSUN3Q9H649 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms