Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM12Q9H4Q4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM12Q9H4Q4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms