Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF41Q9H4P4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF41Q9H4P4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms