Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NXF3Q9H4D5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NXF3Q9H4D5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms