Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LINC00597Q9H2U6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00597Q9H2U6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms