Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX5Q9H2C1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHX5Q9H2C1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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