Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms