Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CIPCQ9C0C6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIPCQ9C0C6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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