Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPS2Q9BXY5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPS2Q9BXY5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms