Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSK1BQ9BXA7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSK1BQ9BXA7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms