Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERPUD2Q9BSE4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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