Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RIOK1Q9BRS2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIOK1Q9BRS2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms