Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEC22CQ9BRL7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SEC22CQ9BRL7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms