Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EBF4Q9BQW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EBF4Q9BQW3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms