Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF15Q99988 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF15Q99988 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms