Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CITED1Q99966 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms